《保健食品注册管理办法》作为规范保健食品注册与备案管理的重要部门规章，对保健食品注册证书持有人的变更申请与审批程序作出了明确规定。对于“境外变更为境内的技术转让”这一特定情形，其是否适用及如何适用，需结合法规条文与监管实践进行具体分析。

从法规依据上看，《保健食品注册管理办法》中关于变更注册的规定，主要针对已获注册证书产品的注册人、产品名称、配方、生产工艺、质量标准等技术内容发生变更的情形。其中，注册人变更属于重大变更事项之一。当技术转让涉及注册人从境外持有人变更为境内持有人时，这本质上属于注册人主体的跨境变更，应当纳入“变更注册”的范畴进行管理。因此，从制度设计上讲，该办法所确立的变更申请与审批程序，在原则上适用于境外转境内的技术转让活动。

从操作流程和监管要求来看，此类跨境技术转让的变更申请，除了需要满足办法中关于变更注册的一般性要求（如提交变更申请表、证明文件、产品技术研究资料等）外，通常还会面临一些特殊考量。这主要包括：

1. 原境外注册人的资质与转让合法性：需提供经公证认证的境外注册人同意转让的证明文件，以及其合法的持有人资格证明。
2. 境内受让方的资质要求：境内受让方（即新的注册申请人）必须具备与所承接产品相适应的研发、生产、质量管理和责任赔偿能力，并通常是依法设立的境内保健食品生产企业。
3. 技术资料的完整转移与衔接：必须确保产品的配方、生产工艺、质量标准、安全性评估等全套核心技术资料，从原境外持有人完整、真实、准确地转移至境内受让方，并符合中国法规标准要求。必要时，监管部门可能要求补充针对中国人群的相关研究数据或进行技术审评。
4. 生产场地的变更与符合性：技术转让往往伴随着生产场地从境外转移到境内，这要求境内的生产企业必须通过保健食品生产许可，其生产条件完全符合中国《保健食品良好生产规范》（GMP）要求。此生产许可的获取通常是完成注册人变更审批的前提条件之一。
5. 审批程序的特殊性：由于涉及跨境因素，此类变更申请的审评审批可能会更加严格，时间可能相对较长，需要经过国家市场监督管理总局相关技术审评机构的详细审核。

《保健食品注册管理办法》所规定的变更申请与审批程序，是适用于“境外变更为境内的技术转让”这一情形的核心管理框架。在实际操作中，该过程并非简单的资料过户，而是一个融合了主体变更、技术跨境转移、生产体系本土化重建以及符合中国特定监管标准的综合性注册管理过程。企业需要提前进行周密规划，准备详尽且符合要求的申报资料，并与监管部门保持充分沟通，以确保技术转让合法、合规、顺利地完成。

需要提醒的是，法规与实践处于动态发展中，在进行具体操作前，建议相关方详细查阅最新版的《保健食品注册管理办法》及其配套文件，并咨询专业法规服务机构或直接向国家市场监督管理部门进行确认，以获取最权威、最及时的指导。